Os sítios arqueológicos em São José do Cerrito atestam o denso povoamento do grupo indígena Jê Meridional por um período de 1100 anos. Um dos maiores e mais representativos sítios arqueológicos encontra-se na comunidade de Rincão dos Albinos.
As marcas deixadas no solo pelas choupanas de palha com piso rebaixado, conhecidas como casas subterrâneas, formam hoje a maior concentração desse tipo de estrutura em todo o Brasil.
